提速近10倍!基于深度学习的全基因组选择新方法来了******
近日,中国农业科学院作物科学研究所、三亚南繁研究院大数据智能设计育种创新团队联合多家单位提出利用植物海量多组学数据进行全基因组预测的深度学习方法, 可以实现育种大数据的高效整合与利用,将助力深度学习在全基因组选择中的应用,为智能设计育种及平台构建提供有效工具。相关研究成果发表在《分子植物(Molecular Plant)》上。
全基因组选择作为新一代育种技术,通过构建预测模型,根据基因组估计育种值进行早期个体的预测和选择,从而缩短育种世代间隔,加快育种进程,节约成本,推动现代育种向精准化和高效化方向发展。
统计模型作为全基因组选择的核心,极大地影响了全基因组预测的准确度和效率。传统预测方法基于线性回归模型,难以捕捉基因型和表型间的复杂关系。
相较于传统模型,非线性模型(如深度网络神经)具备分析复杂非加性效应的能力,人工智能和深度学习算法为解决大数据分析和高性能并行运算等难题提供了新的契机,深度学习算法的优化将会提高全基因组选择的预测能力。
该研究团队以玉米、小麦和番茄3种作物的4种不同维度的群体数据为测试材料,通过创新深度学习算法框架开发了全基因组选择新方法。
与其他五种主流预测方法相比,该方法有以下优点: 可以利用多组学数据开展全基因组预测;算法设计中包含批归一化层、回调函数和校正线性激活函数等结构,可以有效降低模型错误率,提高运行速度;预测精度稳健,在小型数据集上的表现与目前主流预测模型相当,在大规模数据集上预测优势更加明显;计算时间与传统方法相近,比已有深度学习方法提速近10倍;超参数调整对用户更加友好。
该研究得到了国家重点研发计划、国家自然科学基金、海南崖州湾种子实验室和中国农业科学院科技创新工程等项目的支持。
学术支持
中国农业科学院作物科学研究所
记者
宋雅娟
法甲举办“中国日”活动庆祝兔年春节******
中新社巴黎1月31日电 (记者 李洋)法国职业足球联盟又一次迎来“中国日”。中国驻法国大使馆与法国欧塞尔足球俱乐部当地时间29日共同举办“中国日”活动,庆祝癸卯兔年春节。
法甲此次“中国日”的主要活动地点是在法国中部城市欧塞尔市阿贝·德尚体育场。记者在现场看到,体育场看台上设有“虎辞胜岁,兔跃新程,欧塞尔俱乐部同中国驻法大使馆恭祝广大球迷朋友们2023新春开运,大展鸿兔!”的标语。
当地时间1月29日,法国职业足球联盟又一次迎来“中国日”。中国驻法国大使馆与法国欧塞尔足球俱乐部共同举办“中国日”活动,庆祝癸卯兔年春节。图为欧塞尔市阿贝·德尚体育场看台上设有“虎辞胜岁,兔跃新程,欧塞尔俱乐部同中国驻法大使馆恭祝广大球迷朋友们2023新春开运,大展鸿兔!”的标语。 中新社记者 李洋 摄比赛开始前,体育场外举行了舞龙舞狮表演,吸引大批球迷驻足观看。多家机构还在体育场外设置展台,介绍美食旅游等中华文化。中国驻法国大使卢沙野与欧塞尔足球俱乐部执行主席马尔赫伯等共同为彩狮点睛。
随后,卢沙野来到球场接受记者采访。他表示,用体育连接中法两国人民,是很有效的纽带。在当前国际背景下,国与国之间,人与人之间,更应该加强文化交流和情感沟通,增进友好感情。
卢沙野说,将法国的足球文化与中国的春节文化相结合举办活动已进行多年,他前几年在巴黎参加多场相关活动,感到很有意义。他希望相关活动能够在推动中法关系发展方面继续发挥积极作用。
当地时间1月29日,法国职业足球联盟又一次迎来“中国日”。中国驻法国大使馆与法国欧塞尔足球俱乐部共同举办“中国日”活动,庆祝癸卯兔年春节。中国驻法国大使卢沙野(前排左四)与欧塞尔足球俱乐部执行主席马尔赫伯等嘉宾在欧塞尔市阿贝·德尚体育场外与华人舞龙舞狮队合影。 中新社记者 李洋 摄当天法甲第20轮比赛,欧塞尔主场对阵蒙彼利埃,卢沙野受邀为比赛开球。数百名华侨华人也来到现场观看比赛。尽管欧塞尔队不断展开攻势,但未能进球。最终欧塞尔0:2不敌蒙彼利埃。
另悉,29日巴黎圣日耳曼对阵兰斯的比赛中,巴黎圣日耳曼球员也身着印有中文名字的队服参加比赛,其中包括著名球星梅西、姆巴佩、内马尔等,他们共同为中国球迷送上新春祝福。(完)
(文图:赵筱尘 巫邓炎) [责编:天天中] 阅读剩余全文() |